Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP3O43295 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP3O43295 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP3O43295 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms