Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPSS1O43252 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPSS1O43252 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPSS1O43252 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPSS1O43252 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPSS1O43252 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPSS1O43252 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms