Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLXNB1O43157 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms