Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
FANCAO15360 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FANCAO15360 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FANCAO15360 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
FANCAO15360 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCAO15360 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FANCAO15360 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FANCAO15360 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FANCAO15360 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FANCAO15360 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCAO15360 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FANCAO15360 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FANCAO15360 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
FANCAO15360 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
FANCAO15360 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FANCAO15360 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FANCAO15360 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FANCAO15360 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FANCAO15360 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FANCAO15360 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FANCAO15360 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FANCAO15360 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FANCAO15360 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FANCAO15360 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FANCAO15360 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
FANCAO15360 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FANCAO15360 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms