Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TO15178 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TO15178 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TO15178 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TO15178 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TO15178 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TO15178 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TO15178 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TO15178 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TO15178 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TO15178 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TO15178 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TO15178 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TO15178 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TO15178 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TO15178 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TO15178 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TO15178 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TO15178 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms