Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ANKRD28O15084 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD28O15084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260 ms