Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F3O00716 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2F3O00716 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1
E2F3O00716 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E2F3O00716 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2F3O00716 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2F3O00716 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2F3O00716 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2F3O00716 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2F3O00716 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E2F3O00716 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F3O00716 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E2F3O00716 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2F3O00716 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2F3O00716 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms