Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms