Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
O00370 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
O00370 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
O00370 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
O00370 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
O00370 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
O00370 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
O00370 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
O00370 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms