Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TULP2O00295 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TULP2O00295 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TULP2O00295 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TULP2O00295 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TULP2O00295 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TULP2O00295 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms