Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNAP23O00161 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNAP23O00161 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms