Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms