Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H7C1W4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H7C1W4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
H7C1W4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
H7C1W4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1W4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1W4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1W4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1W4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H7C1W4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H7C1W4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
H7C1W4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
H7C1W4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
H7C1W4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
H7C1W4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
H7C1W4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
H7C1W4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms