Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H7C0C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H7C0C1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H7C0C1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H7C0C1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H7C0C1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H7C0C1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H7C0C1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms