Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms