Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms