Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLRF2D3W0D1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLRF2D3W0D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms