Protein–RNA interactions for Protein: C9JCN9

HSBP1L1, Heat shock factor-binding protein 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSBP1L1C9JCN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSBP1L1C9JCN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSBP1L1C9JCN9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms