Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3P2A8K0S8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MEIS3P2A8K0S8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms