Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOBPA7XYQ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOBPA7XYQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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