Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
YJEFN3A6XGL0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
YJEFN3A6XGL0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
YJEFN3A6XGL0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms