Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM200CA6NKL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms