Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPB15A6NHN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPB15A6NHN6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms