Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA6BA6NDN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOLGA6BA6NDN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms