Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37CA5D8V6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms