Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms