Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE3A1L190 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE3A1L190 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE3A1L190 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms