Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A1B0GVM2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms