Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A1B0GTW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A1B0GTW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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