Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CAPN9-201ENST00000271971 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GRM3-203ENST00000439827 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RAD51C-201ENST00000337432 2591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ADGRE3-203ENST00000443157 1971 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NUDT9P1-201ENST00000477230 745 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF576-204ENST00000528387 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CHST9-201ENST00000580774 2033 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RPS6KA2-203ENST00000405189 2282 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TAS1R1-202ENST00000351136 1871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ANKRD42-203ENST00000393392 2302 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF221-202ENST00000587682 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC090952.2-201ENST00000635800 1620 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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