Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GAPDHP67-201ENST00000422905 788 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ITGAX-204ENST00000562918 1521 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RPL13AP17-204ENST00000450028 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 KRT8P15-201ENST00000425226 1451 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00840-201ENST00000431737 1974 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00923-201ENST00000503768 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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