Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TUBAL3-202ENST00000479328 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 PAX3-202ENST00000336840 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC020917.3-201ENST00000621050 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 BTN2A2-206ENST00000469230 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LMO3Q8TAP4 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PALM2-201ENST00000314527 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GSTA2-201ENST00000493422 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LYSMD3-204ENST00000509384 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CASP7-203ENST00000369318 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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