Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A4Q9Y6R1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A4Q9Y6R1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms