Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP3Q9Y6F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms