Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPQQ9Y646 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPQQ9Y646 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms