Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIKFYVEQ9Y2I7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms