Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNNQ9UQP3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNNQ9UQP3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms