Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF24Q9UPV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF24Q9UPV7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF24Q9UPV7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms