Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHF8Q9UPP1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PHF8Q9UPP1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHF8Q9UPP1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms