Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNRF3Q9ULT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNRF3Q9ULT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms