Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ0

STRIP2, Striatin-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP2Q9ULQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRIP2Q9ULQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP2Q9ULQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms