Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R9AQ9ULJ8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R9AQ9ULJ8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms