Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRPF3Q9ULD4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRPF3Q9ULD4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms