Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN16Q9UKR8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms