Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC5Q9UII4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms