Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PUF60Q9UHX1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms