Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
OPN4Q9UHM6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms