Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHORDC1Q9UHD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHORDC1Q9UHD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms