Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF1Q9UH73 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EBF1Q9UH73 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms