Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP4Q9UGJ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBGCP4Q9UGJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms